Скиммерные бассейны имеют в своей конструкции специальные устройства-скиммеры, через которые забирается из чаши бассейна верхний слой воды. Скиммеры обычно располагаются ниже верхней кромки бассейна примерно на 10-20 см, при этом уровень воды в бассейне находится на горизонтальной оси скиммеров. Уровень воды поддерживается специальным устройством долива.
Через скиммеры загрязненная вода поступает в систему фильтрации, проходит там очистку, затем подается на подогрев и дезинфекцию и через форсунки поступает обратно в чашу бассейна. Форсунки зачастую устанавливаются напротив скиммеров, а также ближе ко дну чаши, обеспечивая тем самым ликвидацию застойных зон и равномерное распределение воды в бассейне.